Danties kanalų gydymas pradedamas nuo danties būklės ir atliktos rentgeno nuotraukos įvertinimo. Danties būklė yra įvertinama tada, kai pašalinamos visos senos restauracijos (plombos), išvalomi pažeisti danties audiniai. Matant likusių sveikų danties audinių būklę, galima spręsti ar verta tokį dantį pradėti gydyti. Endodontinio gydymo metu labai svarbu, kad į danties vidų nepatektų seilių. Todėl ruošiantis atlikti endodontinį gydymą svarbu atstatyti trūkstamas danties sieneles, suformuoti endodontinę “dėžutę”. Suformavus tokią “dėžutę” ant danties lengviau uždedamas koferdamo žiedas ir taip dantis pilnai izoliuojamas koferdamo sistema.
Išvalius ir paruošus danties šaknies kanalus plombavimui, kanalai užpildomi specialia plombine medžiaga, vadinama gutaperča. Dantis po kanalų plombavimo dažniausiai atstatomas su laikina plomba.
Endodontinis gydymas yra atliekamas per vieną ar kelis vizitus, tai priklauso nuo situacijos sudėtingumo ir ligos.